Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
DroshaQ5HZJ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,23■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
DroshaQ5HZJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34,18■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34,17■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
DroshaQ5HZJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
DroshaQ5HZJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34,07■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,04■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
DroshaQ5HZJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33,98■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
DroshaQ5HZJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33,95■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
DroshaQ5HZJ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33,84■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3,01
DroshaQ5HZJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33,82■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33,81■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms