Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8bQ5DU41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc8bQ5DU41 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8bQ5DU41 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc8bQ5DU41 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms