Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r3cQ3V0Y1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3cQ3V0Y1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms