Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zmat1Q3V0C1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zmat1Q3V0C1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zmat1Q3V0C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zmat1Q3V0C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zmat1Q3V0C1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms