Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim80Q3V061 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim80Q3V061 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim80Q3V061 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim80Q3V061 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms