Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defb48Q3UW22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defb48Q3UW22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defb48Q3UW22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Defb48Q3UW22 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Defb48Q3UW22 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defb48Q3UW22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defb48Q3UW22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defb48Q3UW22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Defb48Q3UW22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Defb48Q3UW22 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms