Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdkl5Q3UTQ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdkl5Q3UTQ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdkl5Q3UTQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdkl5Q3UTQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdkl5Q3UTQ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkl5Q3UTQ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkl5Q3UTQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms