Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ22

Ntn5, Netrin-5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn5Q3UQ22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn5Q3UQ22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntn5Q3UQ22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn5Q3UQ22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms