Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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D13Ertd608eQ3UPR8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D13Ertd608eQ3UPR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
D13Ertd608eQ3UPR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms