Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem241Q3UME2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms