Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Arfgef3Q3UGY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21,31■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21,31■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,29■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21,28■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Arfgef3Q3UGY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21,2■□□□□ 0,99
Arfgef3Q3UGY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Arfgef3Q3UGY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms