Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd8Q3UFK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmd8Q3UFK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd8Q3UFK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd8Q3UFK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd8Q3UFK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms