Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tatdn3Q3U1C6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tatdn3Q3U1C6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tatdn3Q3U1C6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tatdn3Q3U1C6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms