Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc9Q3U0M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc9Q3U0M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc9Q3U0M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc9Q3U0M1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms