Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc28Q3TX51 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc28Q3TX51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc28Q3TX51 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms