Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf6Q3TWW8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srsf6Q3TWW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf6Q3TWW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf6Q3TWW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms