Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3TTL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3TTL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3TTL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms