Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde12Q3TIU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde12Q3TIU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde12Q3TIU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms