Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem104Q3TB48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem104Q3TB48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem104Q3TB48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem104Q3TB48 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms