Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell1Q2VWQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nell1Q2VWQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nell1Q2VWQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell1Q2VWQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nell1Q2VWQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nell1Q2VWQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nell1Q2VWQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nell1Q2VWQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nell1Q2VWQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nell1Q2VWQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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