Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Chrna5Q2MKA5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Chrna5Q2MKA5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Chrna5Q2MKA5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Chrna5Q2MKA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Chrna5Q2MKA5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Chrna5Q2MKA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,6 ms