Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb8Q0VBD0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb8Q0VBD0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb8Q0VBD0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms