Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnma1Q08460 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnma1Q08460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Kcnma1Q08460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnma1Q08460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms