Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnn1Q08091 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn1Q08091 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn1Q08091 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms