Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HgfQ08048 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HgfQ08048 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HgfQ08048 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HgfQ08048 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HgfQ08048 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HgfQ08048 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HgfQ08048 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HgfQ08048 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HgfQ08048 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HgfQ08048 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HgfQ08048 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HgfQ08048 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HgfQ08048 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HgfQ08048 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms