Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf9Q05BQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Igsf9Q05BQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf9Q05BQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Igsf9Q05BQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms