Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcad1Q04692 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcad1Q04692 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcad1Q04692 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcad1Q04692 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms