Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp3Q03402 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp3Q03402 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms