Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax5Q02650 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax5Q02650 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax5Q02650 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax5Q02650 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 895.4 ms