Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RykQ01887 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RykQ01887 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RykQ01887 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RykQ01887 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RykQ01887 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RykQ01887 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RykQ01887 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RykQ01887 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RykQ01887 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RykQ01887 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RykQ01887 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RykQ01887 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RykQ01887 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RykQ01887 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RykQ01887 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RykQ01887 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RykQ01887 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RykQ01887 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RykQ01887 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RykQ01887 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RykQ01887 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RykQ01887 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RykQ01887 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RykQ01887 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RykQ01887 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RykQ01887 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RykQ01887 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RykQ01887 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RykQ01887 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RykQ01887 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RykQ01887 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RykQ01887 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RykQ01887 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RykQ01887 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RykQ01887 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RykQ01887 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RykQ01887 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RykQ01887 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RykQ01887 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RykQ01887 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RykQ01887 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RykQ01887 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RykQ01887 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RykQ01887 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RykQ01887 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RykQ01887 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RykQ01887 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RykQ01887 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RykQ01887 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RykQ01887 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RykQ01887 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RykQ01887 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RykQ01887 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RykQ01887 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RykQ01887 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RykQ01887 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RykQ01887 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RykQ01887 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RykQ01887 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RykQ01887 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RykQ01887 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RykQ01887 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RykQ01887 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RykQ01887 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RykQ01887 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RykQ01887 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RykQ01887 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RykQ01887 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms