Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SelpQ01102 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SelpQ01102 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SelpQ01102 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SelpQ01102 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SelpQ01102 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SelpQ01102 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SelpQ01102 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SelpQ01102 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SelpQ01102 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SelpQ01102 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SelpQ01102 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SelpQ01102 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms