Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrcdQ00LT2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrcdQ00LT2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms