Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb2Q00977 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Gjb2Q00977 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gjb2Q00977 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb2Q00977 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gjb2Q00977 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb2Q00977 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjb2Q00977 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms