Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp4Q00724 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp4Q00724 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp4Q00724 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms