Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn1bP97952 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scn1bP97952 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms