Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp7P97864 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp7P97864 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp7P97864 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casp7P97864 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp7P97864 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp7P97864 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp7P97864 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp7P97864 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp7P97864 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms