Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc35b1P97858 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc35b1P97858 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc35b1P97858 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc35b1P97858 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms