Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2cP97760 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2cP97760 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2cP97760 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms