Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmklr1P97468 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmklr1P97468 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmklr1P97468 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmklr1P97468 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmklr1P97468 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmklr1P97468 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmklr1P97468 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmklr1P97468 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms