Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nbr1P97432 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nbr1P97432 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nbr1P97432 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nbr1P97432 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nbr1P97432 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nbr1P97432 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nbr1P97432 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nbr1P97432 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nbr1P97432 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nbr1P97432 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms