Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx1P80205 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx1P80205 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx1P80205 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx1P80205 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx1P80205 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx1P80205 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Otx1P80205 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Otx1P80205 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx1P80205 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Otx1P80205 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms