Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldb1P70662 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldb1P70662 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldb1P70662 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ldb1P70662 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldb1P70662 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms