Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ErfP70459 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ErfP70459 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ErfP70459 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ErfP70459 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ErfP70459 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ErfP70459 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ErfP70459 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ErfP70459 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ErfP70459 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ErfP70459 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ErfP70459 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErfP70459 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErfP70459 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErfP70459 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ErfP70459 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErfP70459 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErfP70459 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErfP70459 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErfP70459 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErfP70459 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErfP70459 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErfP70459 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErfP70459 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErfP70459 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErfP70459 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErfP70459 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErfP70459 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErfP70459 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErfP70459 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErfP70459 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErfP70459 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErfP70459 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ErfP70459 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErfP70459 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErfP70459 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErfP70459 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErfP70459 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErfP70459 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErfP70459 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErfP70459 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErfP70459 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErfP70459 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErfP70459 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErfP70459 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErfP70459 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ErfP70459 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ErfP70459 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ErfP70459 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ErfP70459 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ErfP70459 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ErfP70459 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ErfP70459 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ErfP70459 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ErfP70459 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ErfP70459 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ErfP70459 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ErfP70459 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ErfP70459 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ErfP70459 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ErfP70459 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms