Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc8a1P70414 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a1P70414 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a1P70414 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc8a1P70414 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc8a1P70414 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc8a1P70414 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc8a1P70414 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc8a1P70414 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a1P70414 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms