Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NficP70255 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NficP70255 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NficP70255 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NficP70255 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NficP70255 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NficP70255 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NficP70255 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NficP70255 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NficP70255 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NficP70255 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NficP70255 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NficP70255 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NficP70255 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NficP70255 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NficP70255 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NficP70255 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NficP70255 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NficP70255 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NficP70255 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NficP70255 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NficP70255 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NficP70255 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NficP70255 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NficP70255 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NficP70255 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NficP70255 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NficP70255 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NficP70255 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NficP70255 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NficP70255 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NficP70255 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NficP70255 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NficP70255 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NficP70255 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NficP70255 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NficP70255 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NficP70255 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NficP70255 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NficP70255 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NficP70255 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NficP70255 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NficP70255 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NficP70255 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NficP70255 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NficP70255 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NficP70255 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NficP70255 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NficP70255 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NficP70255 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NficP70255 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NficP70255 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NficP70255 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NficP70255 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NficP70255 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NficP70255 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NficP70255 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NficP70255 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NficP70255 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NficP70255 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NficP70255 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NficP70255 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NficP70255 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NficP70255 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NficP70255 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms