Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC49,3■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC49,29■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC49,29■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,27■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,26■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49,26■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49,26■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,25■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC49,25■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,24■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,22■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC49,2■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC49,2■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC49,19■■■■■ 5,47
Abcc9P70170 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,18■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC49,17■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,16■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,15■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,15■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC49,14■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,14■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC49,14■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49,14■■■■■ 5,46
Abcc9P70170 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,13■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,12■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,12■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49,11■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,09■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,09■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC49,09■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,07■■■■■ 5,45
Abcc9P70170 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC49,06■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,06■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,06■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC49,06■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,05■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,03■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC49,03■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,02■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,01■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,01■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC49,01■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC49,01■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49,01■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5,44
Abcc9P70170 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC48,99■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,98■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC48,98■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,98■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC48,97■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,97■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,96■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC48,95■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,95■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,94■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC48,94■■■■■ 5,43
Abcc9P70170 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC48,93■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC48,93■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,93■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,93■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,91■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC48,9■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,88■■■■■ 5,42
Abcc9P70170 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,86■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,86■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,85■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC48,85■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,84■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC48,84■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC48,83■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC48,82■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC48,82■■■■■ 5,41
Abcc9P70170 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,81■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC48,81■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,8■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,79■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,78■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC48,76■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC48,76■■■■■ 5,4
Abcc9P70170 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,74■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,73■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC48,72■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC48,71■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC48,71■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48,7■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC48,69■■■■■ 5,39
Abcc9P70170 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC48,69■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC48,68■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC48,68■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC48,67■■■■■ 5,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,9 ms