Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacng7P62956 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacng7P62956 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacng7P62956 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacng7P62956 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacng7P62956 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms