Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,09□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,08□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,08□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14,08□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14,08□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,07□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14,07□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,06□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,06□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14,06□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,06□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,05□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,05□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC14,05□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,05□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14,03□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,02□□□□□ -0,16
Rps28P62858 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14,02□□□□□ -0,16
Rps28P62858 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,02□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,99□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,99□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,99□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,98□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13,98□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,98□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,98□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,97□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Rps28P62858 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,95□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,94□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13,94□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,94□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,93□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13,93□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,93□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,93□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,93□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,92□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13,91□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Rps28P62858 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,9□□□□□ -0,18
Rps28P62858 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
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