Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab2P62482 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnab2P62482 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnab2P62482 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnab2P62482 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnab2P62482 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnab2P62482 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnab2P62482 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms