Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smg6P61406 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smg6P61406 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smg6P61406 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smg6P61406 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smg6P61406 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smg6P61406 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smg6P61406 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smg6P61406 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smg6P61406 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smg6P61406 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smg6P61406 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smg6P61406 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smg6P61406 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Smg6P61406 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smg6P61406 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smg6P61406 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smg6P61406 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Smg6P61406 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smg6P61406 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smg6P61406 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smg6P61406 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smg6P61406 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smg6P61406 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smg6P61406 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms